《攻殼機(jī)動(dòng)隊(duì)2015劇場(chǎng)版》講述公元2029年3月，日本總理大臣暗殺事件出現(xiàn)。在聞所未聞的恐怖襲擊中，草薙素子曾從屬的501機(jī)關(guān)的上司庫(kù)露茲也成為了被害者。戰(zhàn)后最兇惡的事件爆發(fā)，素子等人立刻開始搜査。隨著調(diào)查深入，素子開始追查犯人頭目，為此，她召集曾合作過的能人異士。這些人大多從未有過團(tuán)隊(duì)合作的經(jīng)驗(yàn)，因此最初并不順利，但即使如此，大家也一點(diǎn)點(diǎn)揭示出事件的真相。在大使館中發(fā)生的人質(zhì)事件、總理大臣暗殺事件的背后，他們發(fā)現(xiàn)了一種特殊的電腦病毒fire starter，隨后大家發(fā)現(xiàn)，這件事與素子誕生的秘密有關(guān)當(dāng)理解恐怖事件的全貌之時(shí)，素子等怪人集團(tuán)也陷入危機(jī)，漸漸走入絕境，此時(shí)素子向大家下令：聽從自己的GHOST。這便是后來以STAND ALONE TEAM聞名的攻殼機(jī)動(dòng)隊(duì)誕生的故事。